實驗結(jié)果這么難重復(fù),怎樣才能提高重復(fù)性呢?
實驗結(jié)果這么難重復(fù),怎樣才能提高重復(fù)性呢?
剛開始做實驗的時候,有一次發(fā)現(xiàn)一篇文章所用的細胞,處理藥物和我現(xiàn)在的課題一模一樣。那么我想用文章中的處理時間及濃度是不是可以做出來同樣的結(jié)果?當時已經(jīng)很晚了,看我還沒走,一個前輩問我怎么還不回去。我說我正在重復(fù)一篇文章中的實驗,這時她意味深長的說了一句話:“重復(fù)別人的實驗?有時候你連自己做過的實驗可能都重復(fù)不出來!當時我聽后不以為然,心想:怎么可能連自己的實驗都重復(fù)不出來?那肯定是自己的實驗水平有問題唄。工作之后作為技術(shù)支持常接聽客戶咨詢電話,有客戶會電話進來表示實驗結(jié)果無法重復(fù):即使用同樣的樣本、同樣的抗體,昨天可以做出來了,今天卻沒有條帶。有時候是抗體批次問題,換了個批次實驗就無法重復(fù)了。不僅我們普通實驗者,一些學(xué)術(shù)權(quán)威們也有這樣的困惑:耶魯大學(xué)某著名的病理學(xué)家曾用抗體開發(fā)了一個黑色素瘤治療的診斷試劑。但花費了大量的時間和金錢后,卻發(fā)現(xiàn)新的抗體無法重復(fù)之前的結(jié)果,原來這個抗體特異性存在問題,只能被迫停止了這個項目。因此近幾年來,很多學(xué)者都紛紛認為應(yīng)該重視起抗體的問題,同時也要求抗體行業(yè)進行自我約束。
為什么實驗結(jié)果很難重復(fù)呢?主要有5個方面的原因:1、參考文獻;2、生產(chǎn)商;3、經(jīng)銷商;4、搜索引擎;5、同行審閱。下面讓我們具體來看下這5個方面以及如何解決這幾方面帶來的困擾。
1、參考文獻:是我們選擇抗體的主要方式。當我們選擇抗體的時候,最常用的方法是聽取同行的推薦或者查閱參考文獻,看看別人用了什么得到了滿意的實驗結(jié)果。但是通常會遇到2個問題:當你用搜索引擎去搜尋抗體時,發(fā)現(xiàn)有的文章并沒有標明使用的哪個抗體;或者所查文獻標注使用了另一參考文獻的抗體,你又進一步查閱--——找了半天,卻發(fā)現(xiàn)最初的那個作者并沒有標明到底用了具體哪個抗體。所以有的參考文獻的缺點就是沒有抗體的具體信息。
在這種背景下,我們需要選擇性地參考參考文獻。一個簡單粗暴的方法,就是選擇那些影響因子比較高的文章,比如大于5分,可以在一定程度上保證當你Follow別人的實驗步驟時,有更大的可能重復(fù)出來;也可以選擇那些標注了抗體貨號、稀釋比例和生產(chǎn)廠家的文章,減少反復(fù)試驗各種抗體的時間。
2、用生產(chǎn)商的網(wǎng)站:有些公司號稱生產(chǎn)商,但是卻只生產(chǎn)極少量的抗體,絕大部分抗體是從其他公司OEM過來的,因此質(zhì)量參差不齊。有些公司不告訴客戶怎么驗證抗體,而讓用戶自己去檢測。有些公司雖然秀了數(shù)據(jù),但是這些數(shù)據(jù)卻非常有限,僅僅是告訴你這個抗體可以用于何種應(yīng)用,并沒有說明到底檢測的是什么?是否有交叉反應(yīng)?往往我們抱怨比較多的是這些公司不提供完整的驗證抗體的數(shù)據(jù),批次質(zhì)量不穩(wěn)定。
作為研究人員,一定要選擇重視抗體質(zhì)量的真正的生產(chǎn)商。CST一直以為科研人員提供最高質(zhì)量的抗體作為使命,在生產(chǎn)過程中非常重視抗體特異性、靈敏度、批次間一致性的檢測,并將驗證數(shù)據(jù)公布在網(wǎng)站上,對于大家選擇抗體非常有幫助。有些未公布的驗證失敗的數(shù)據(jù),如果研究人員問詢,CST的研發(fā)科學(xué)家都非常樂意分享。這就是為什么CST能夠?qū)掖潍@得“最佳抗體”、“最有用的網(wǎng)站”、“最佳客戶服務(wù)”、“研究者的首選抗體”、“五個第一”等殊榮的原因。
選擇一個靠譜的廠家至關(guān)重要,其實從廠家所提供的產(chǎn)品說明書的詳細程度就可以來判斷這個廠家是不是可靠,詳細并不是說篇幅越長越好,而是看實驗種類是不是經(jīng)過驗證,有沒有提供實驗所需要的詳細試劑。CST所有的抗體都是經(jīng)過嚴格篩選和驗證的,實驗步驟都是經(jīng)過優(yōu)化的,我們希望客戶通過網(wǎng)站就可以發(fā)現(xiàn)更多產(chǎn)品的相關(guān)信息,而且我們花費了很多時間來優(yōu)化實驗方法,比如在WB一抗稀釋液這一步,到底是用脫脂奶粉稀釋還是BSA稀釋,可以看說明書下方的紅色方框,可能有時候差異不是很大,但很多時候差異還是很明顯的;在說明書右方也會提到具體的稀釋比例以及稀釋buffer,比如IHC到底是用檸檬酸鹽修復(fù)還是EDTA修復(fù),在說明書上都可以看到,同時我們也有很多小冊子,像WB成功實驗指南,IHC實驗成功指南等等,而且還會檢測每一個批號,確保新的批號和舊的批號是一樣的實驗結(jié)果,對抗體的靈敏度、 特異性、反應(yīng)性、穩(wěn)定性方面都會做相關(guān)的測試。
3、經(jīng)銷商:當今科研市場,供應(yīng)商的競爭十分激烈,非正規(guī)的供應(yīng)商如果想走出一條活路,即使它沒有任何生產(chǎn)商的授權(quán),也會轉(zhuǎn)賣很多公司的產(chǎn)品。有的供應(yīng)商缺乏專業(yè)的技術(shù)人員,對產(chǎn)品本身不了解,不能給客戶做出專業(yè)的正確的推薦;非正規(guī)的供應(yīng)商經(jīng)常從大的供應(yīng)商那里買來抗體,分裝后重新貼上標簽進行銷售;有的供應(yīng)商甚至直接出售假貨、以次充好,把產(chǎn)品拿過來分裝然后貼上知名產(chǎn)品的標簽。因為整個市場不透明,導(dǎo)致用戶所看到的產(chǎn)品信息,并不等同于生產(chǎn)商所提供的信息,最終導(dǎo)致科研人員買到質(zhì)量很差的產(chǎn)品甚至假貨。
作為研究人員,一定要擦亮眼睛,盡可能從生產(chǎn)商授權(quán)的代理商處購買。授權(quán)代理商可以從生產(chǎn)商的網(wǎng)站上查詢得到,也可以直接打電話給生產(chǎn)商詢問。詢問實驗室的老師和管理人員,尋找長期合作的可靠的代理商。點擊此處查看CST 授權(quán)代理商。
4、第三方產(chǎn)品平臺網(wǎng)站,比如CiteAb, Biocompare等,其實很多產(chǎn)品都是不斷更新的。排名最靠前,引用文獻最多的并不一定是這個供應(yīng)商最好的產(chǎn)品,而僅僅是生產(chǎn)最久的產(chǎn)品。
因此,除了看引用文獻最多的產(chǎn)品,還可以在平臺通過關(guān)鍵詞搜索,查看符合條件的多個產(chǎn)品,結(jié)合生產(chǎn)商網(wǎng)站上提供的驗證數(shù)據(jù)等進行綜合考量。就抗體而言,實驗多檢測來自于人、小鼠、大鼠的樣本,作為來自于更遠源種屬的兔單抗,其特異性和靈敏度更好,可優(yōu)先選擇。
5、同行審閱。往往發(fā)表文章的時候,不需要提供詳細的操作方法及全部的驗證數(shù)據(jù)??赡苡行┮寻l(fā)表的實驗結(jié)果并沒有做3-5次的重復(fù)試驗,或者做了之后只是挑選了一幅滿意的圖片。
如果同行審閱們有更加嚴格的評審標準,比如讓用戶盡可能的提供詳細的產(chǎn)品貨號、稀釋比例及試驗步驟,或者有一個專門的網(wǎng)頁來上傳所有的原始圖片(用戶可以參考各出版社的網(wǎng)站,排版說明都有不同的要求,有些雜志還會有專門的網(wǎng)頁來存放這些圖片)供他人參考,不僅會促使整個學(xué)術(shù)界形成一種好的風(fēng)氣,也會減少實驗不可重復(fù)、造假等問題。
CST作為世界領(lǐng)先的抗體生產(chǎn)商,我們會一如既往地重視出廠前的抗體驗證,即特異性、靈敏度、批次間一次性的檢驗,研發(fā)生產(chǎn)抗體的科學(xué)家為大家提供最專業(yè)的技術(shù)支持,網(wǎng)站提供海量的驗證數(shù)據(jù)和信號通路、Phosphosite蛋白修飾數(shù)據(jù)庫等學(xué)術(shù)資源,為實驗的重復(fù)性貢獻我們的專業(yè)力量。我們的口號是“不要讓抗體成為您實驗的變量”,讓多方努力,共同提高整個試劑行業(yè)的可重復(fù)性。
除了上述這幾個宏觀方面,實驗重復(fù)性差還有其他方面的原因。如研究人員沒有嚴格遵循生產(chǎn)商的操作步驟,或者隨意改變實驗系統(tǒng),使實驗變量增加。因此說,除了要有質(zhì)量非??煽康目贵w,還需遵循生產(chǎn)商的操作步驟,選擇合適的模型,客戶的真實反饋等其他方面也同等重要,后續(xù)請繼續(xù)關(guān)注我們的文章,看看如何從微觀方面來提高實驗的可重復(fù)性。
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